Los proyectos actuales
BIMCV-Prostate-Dataset
El BIMCV Prostate Dataset es un conjunto de datos de resonancias magnéticas de próstata, con 9,341 sesiones de 8,441 sujetos recopiladas en 16 centros de salud de la Comunidad Valenciana, España. Incluye imágenes en T2W, DWI, y ADC, y está estructurado según el estándar MIDS para facilitar su uso por investigadores. El dataset tiene una distribución diversa en términos de centros, fabricantes de equipos y características de los pacientes, lo que lo hace valioso para el desarrollo de modelos de inteligencia artificial en oncología de próstata.
Investigador Principal: Maria de la Iglesia Vayá
Data Scientist: Jesús Alejandro Alzate-Grisales
Asistencia Quirúrgica Con Realidad Aumentada
Desarrollo de un sistema de asistencia quirúrgica basado en realidad virtual aumentada y modelos 3D impresos para la planificación preoperatoria y la mejora de resultados en cirugía ortopédica y traumatología.
Investigador Principal: Kateryna Kardash
BIMCV-COVID19
El conjunto de datos BIMCV-COVID19 es un gran conjunto de datos con imágenes de rayos X de tórax CXR (CR, DX) y tomografía computarizada (TC) de pacientes COVID-19 junto con sus hallazgos radiográficos, patologías, reacción en cadena de la polimerasa (PCR), pruebas de anticuerpos diagnósticos de inmunoglobulina G (IgG) e inmunoglobulina M (IgM) e informes radiográficos del Banco de Datos de Imagen Médica de la Comunidad Valenciana (BIMCV). Los hallazgos están mapeados en terminología estándar del Sistema Unificado de Lenguaje Médico (UMLS) y cubren un amplio espectro de entidades torácicas, en contraste con el número mucho más reducido de entidades anotadas en conjuntos de datos anteriores.
Investigador Principal: Maria de la Iglesia Vayá
MIDS
Desarrollo de un estándar para el almacenado y gestión de cualquier modalidad de Imagen Médica. Se pretende conseguir un modelo estandarizado. Siguiendo el establecimiento del Comité sobre mejores practicas en análisis y compartimiento de datos (COBIDAS, www.humanbrainmapping.org/cobidas/) por la sociedad de neuroimagnes mas importantes – la Organización de mapping del cerebro humano (OHBM).
Investigador Principal: Chris Filo Gorgolewski
Data Scientist: Jose Manuel Saborit Torres
PADCHEST
Detección Multifocal en Rayos X para clasificación de patologia pulmonar utilizando IA con Deep Learning.
El objetivo principal del presente proyecto es explorar las técnicas de inteligencia artificial de aprendizaje profundo para la predicción de patologías en radiografías de torax informadas en castellano.
Investigador Principal: Aurelia Bustos Moreno
Data Scientist: Jose María Salinas Serrano
DiSMed
Los textos médicos, como los informes radiológicos o las historias clínicas electrónicas, son una potente fuente de datos para los investigadores. Es necesario desarrollar métodos de anonimización para desidentificar documentos que contengan información personal tanto de pacientes como de personal médico. Aunque actualmente existen varias estrategias de anonimización para el idioma inglés, también dependen del idioma. Aquí presentamos una estrategia de reconocimiento de entidades con nombre para textos médicos en español, traducible a otros idiomas.
Investigador Principal: María de la Iglesia-Vayá
Data Scientist: Irene Pérez-Díez
MIDAS
Identificar los factores pronósticos de cronicidad se ha convertido en una de las prioridades de los investigadores sobre patología lumbar. Los estudios que evalúan la presencia de cambios anatómicos o estructurales en la columna lumbar a través de resonancia magnética y/o discografía no son capaces correlacionar estas anomalías con un mal pronostico en el dolor lumbar.
Investigador Principal: Dr. Julio Doménech Fernández (Hospital Arnau de Villanova).
Data Scientist: Jhon Jairo Saenz Gamboa
10K – BDBI 4 CV
Proporcionar recursos, datos, y herramientas para realizar estudios epidemiológicos avanzados en Imagen Médica Poblacional. Se pretende analizar y controlar la evolución de diferentes patologías neurológicas y buscar distintos patrones poblacionales mediante técnicas de data mining.
Investigador Principal: Dr. Oscar Zurriaga
Data Scientists: María de la Iglesia Vayá & Jose Manuel Saborit-Torres
BRAIN-GIS
Sistema de información geográfica de pacientes de la comunidad valenciana. Se pretende desarrollar herramientas estadísticas para visualizar imágenes paramétricas complejas con diferentes soluciones gráficas, entre ellas WebGL, Virtual Reality (VR), etc.
Investigador Principal: María de la Iglesia-Vayá (CEIB-CS, Brain Connectivity Lab.)
Data Scientist: Joaquim Ángel Montell Serrano
CELEXITA
El objetivo principal del proyecto CELEXITA es la creación del primer marco metodológico integrado para el estudio del conectoma, basado en herramientas de teoría de redes y sistemas complejos, dirigido a la mejora del proceso de diagnóstico e investigación en enfermedades neurológicas.
Investigador Principal: Carlos Rodriguez-Caso (Brain Dynamics®)
MIDL
MIDL propone enfocarse a la extensión de directrices existentes como los que fueron producidos por COBIDAS (y desarrollar nuevas cuando se necesite) a una arquitectura de implementación de aplicación general basada en la federación de recursos de información (biobancos, bases de datos, pequeños y grandes infraestructuras).
La federación es un paso necesario para juntar esta información diversa a un «Lago de Datos» (Woods y Dan, 2011), posiblemente por pasos incrementales empezando por «estanques de datos» (Zanetti, 2016).
Investigador Principal: Maria de la Iglesia Vayá
Data Scientist: Jhon Jairo Saenz Gamboa.
GLIOHABITATS
Caracterizar exhaustivamente el patrón multiparamétrico de signos de tejido de Glioblastoma y su evolución temporal.
Investigador Principal: Juan M García-Gómez (UPV, Biomedical Data Science Lab)
Data Scientist: Aitana Pascual Belda
NEUROBIM-MS
Gestor de Proyectos en I+D aplicado a la Esclerosis Múltiple. NeuroBIM-MS es un sistema de gestión y extracción de conocimiento de imágenes de pacientes con esclerosis múltiple diagnosticada, basada en la implementación de una instancia del modelo general Cloud CEIB I+D.
Investigador Principal: José María Salinas Serrano (Hospital San Juan de Alicante)
Data Scientist at CEIB: Jose Manuel Saborit-Torres
HQBRAIN
Cerebro reproducible y de alta calidad. Este proyecto pretende establecer una estructura clara para la reproducibilidad y control de cualidad de experimentos de imágenes cerebrales, sobretodo en la campo de RM. HQBrain explorara las implementaciones, desde adquisición de imágenes hasta el procesamiento de datos y la evaluación de los resultados, prestando especial atención a soluciones para tratar con la confidencialidad de datos con una vista para proporcionar robustez y confianza en practicas y experimentos de imágenes.
Investigador Principal: Dr. Luis Martí-Bionmatí
Data Scientist: Joaquim Ángel Montell Serrano
Share Your Brain
Dentro del espectro en trastornos del cerebro, podemos destacar los de deterioro cognitivo. Estos trastornos tienen una alta prevalencia, así como también, deficiencias y discapacidades a corto y largo plazo. Por lo tanto, son una carga emocional, financiera y social para los pacientes, sus familias y su red social. Uno de los grandes retos a nivel mundial es el abordaje y estudio del conectoma. La conectómica trata de entender cómo funciona el cerebro a partir de la red de conexiones. En este proyecto se pretende realizar el estudió del conectoma valenciano a partir de la recopilación de imágenes de resonancia magnética (RMI) y electroencefalografía (EEG) hasta alcanzar un conjunto de muestras significativas para el estudio poblacional.