BIMCV-COVID19, Conjuntos de datos relacionados con el curso de patología de COVID19
AVISO (29 de Marzo 2023): ¡Nueva versión del conjunto de datos COVID19+!
AVISO (9 de Julio 2021): Debido a un corte de energía por mantenimiento del BSC, sus servidores podrían no estar disponibles desde el 19 de julio de 2021 a las 07:00h hasta el 26 de julio a las 16:00h
AVISO (20 de Octubre 2020): Debido a la gran demanda de estos conjuntos de datos, se recomienda descargar los datos a través del protocolo WebDAV (por favor, consulte más detalles en la página web de cada conjunto de datos).
BIMCV-COVID19+: a large annotated dataset of RX and CT images of COVID19 patients
El conjunto de datos BIMCV-COVID19+ es un gran conjunto de datos con imágenes de rayos X de tórax CXR (CR, DX) y tomografía computarizada (TC) de pacientes COVID-19 junto con sus hallazgos radiográficos, patologías, reacción en cadena de la polimerasa (PCR), pruebas de anticuerpos diagnósticos de inmunoglobulina G (IgG) e inmunoglobulina M (IgM) e informes radiográficos del Banco de Datos de Imagen Médica de la Comunidad Valenciana (BIMCV). Los hallazgos están mapeados en terminología estándar del Sistema Unificado de Lenguaje Médico (UMLS) y cubren un amplio espectro de entidades torácicas, en contraste con el número mucho más reducido de entidades anotadas en conjuntos de datos anteriores. Las imágenes se almacenan en alta resolución y las entidades se localizan con etiquetas anatómicas en un formato de Estructura de Datos de Imágenes Médicas (MIDS). Además, 23 imágenes fueron anotadas por un equipo de radiólogos expertos para incluir la segmentación semántica de los hallazgos radiográficos. Además, se proporciona amplia información, como los datos demográficos del paciente, el tipo de proyección y los parámetros de adquisición del estudio de imagen, entre otros. Estas iteraciones de la base de datos incluyen 21342 estudios CR, 34829 DX y 7918 CT.
Iter1+2 DOI: 10.21227/w3aw-rv39
Iter1+2+3 DOI: 10.21227/f3q6-0986
Disponibilidad de los datos
El uso de BIMCV-COVID19 es gratuito para todos los investigadores. Los investigadores que deseen utilizar la base de datos clínica completa deben solicitar formalmente el acceso. Al solicitar el acceso, el usuario se compromete a (1) no compartir los datos, (2) no intentar reidentificar a los individuos.
La BIMCV-COVID19, aunque desidentificada, sigue conteniendo información relativa a la atención clínica de los pacientes, y debe ser tratada con el debido respeto. Los investigadores que deseen utilizar la base de datos clínica completa deben solicitar formalmente el acceso.
B2DROP forma parte de los servicios de la Infraestructura Colaborativa de Datos de EUDAT (www.eudat.eu). La instancia de B2DROP utilizada para este trabajo la proporciona el BSC-CNS.
Acuerdo de uso del conjunto de datos para investigación
Por favor, lea el Acuerdo de uso para investigación del conjunto de datos BIMCV-COVID19 antes de descargarlo.
BIMCV-COVID19-: un gran conjunto de datos anotados de imágenes de RX y TC de pacientes sin COVID19
BIMCV-COVID19- dataset es un gran conjunto de datos con imágenes de rayos X de tórax CXR (CR, DX) y tomografía computarizada (CT) de ningún paciente COVID-19 junto con sus hallazgos radiográficos, patologías, reacción en cadena de la polimerasa (PCR), pruebas de anticuerpos diagnósticos de inmunoglobulina G (IgG) e inmunoglobulina M (IgM) e informes radiográficos del Banco de Datos de Imagen Médica de la Comunidad Valenciana (BIMCV). Los hallazgos están mapeados en terminología estándar del Sistema Unificado de Lenguaje Médico (UMLS) y cubren un amplio espectro de entidades torácicas, en contraste con el número mucho más reducido de entidades anotadas en conjuntos de datos anteriores. Las imágenes se almacenan en alta resolución y las entidades se localizan con etiquetas anatómicas en un formato Medical Imaging Data Structure (MIDS).
DOI: 10.21227/m4j2-ap59
Disponibilidad de los datos
El uso de BIMCV-COVID19 es gratuito para todos los investigadores. Los investigadores que deseen utilizar la base de datos clínica completa deben solicitar formalmente el acceso. Al solicitar el acceso, el usuario se compromete a (1) no compartir los datos, (2) no intentar reidentificar a los individuos.
La BIMCV-COVID19, aunque desidentificada, sigue conteniendo información relativa a la atención clínica de los pacientes, y debe ser tratada con el debido respeto. Los investigadores que deseen utilizar la base de datos clínica completa deben solicitar formalmente el acceso.
Acuerdo de uso del conjunto de datos para investigación
Por favor, lea el Acuerdo de uso para investigación del conjunto de datos BIMCV-COVID19 antes de descargarlo.
BIMCV-COVID19-PADCHEST, una reorganización del conjunto de datos PadChest relacionados con el curso de patología de COVID-19
BIMCV-COVID-19 «el conjunto de datos de imágenes Covid 19 llegará lo antes posible, estad atentos». El conjunto de datos Padchest-neumonía, aquí (visita nuestro github).
Siguiendo estrategias e iniciativas comunes surgidas de la comunidad científica a nivel internacional, se están llevando a cabo una serie de acciones dentro del Banco de Imágenes de la Comunitat Valenciana (BIMCV) que combina datos del conjunto de datos PadChest con futuros conjuntos de datos basados en la patología COVID-19 para proporcionar a la comunidad científica abierta datos de valor clínico-científico que ayuden a la detección precoz de COVID-19.
Ejemplo de imagen médica de COVID-19 Rx de medRxiv preprint doi
Disponibilidad de los datos
El uso de BIMCV-COVID19 es gratuito para todos los investigadores. Los investigadores que deseen utilizar la base de datos clínica completa deben solicitar formalmente el acceso. Al solicitar el acceso, el usuario se compromete a (1) no compartir los datos, (2) no intentar reidentificar a los individuos.
La BIMCV-COVID19, aunque desidentificada, sigue conteniendo información relativa a la atención clínica de los pacientes, y debe ser tratada con el debido respeto. Los investigadores que deseen utilizar la base de datos clínica completa deben solicitar formalmente el acceso.
Acuerdo de uso del conjunto de datos para investigación
Por favor, lea el Acuerdo de uso para investigación del conjunto de datos BIMCV-COVID19 antes de descargarlo.
SIIM-FISABIO-RSNA COVID-19 Detection
Covid-Pneumonia Detection Challenge para identificar y localizar anomalías COVID-19 en radiografías de tórax
El conjunto de datos BIMCV-COVID19 se comparte para contribuir al reto Kaggle Covid-Pneumonia Challenge promovido por la Society for Imaging Informatics in Medicine (SIIM) y la Radiological Society of North America (RSNA) para la identificación y localización COVID-19 en radiografía de tórax.
Animamos a todos los científicos de datos e ingenieros de IA de todo el mundo a participar en este Kaggle.
Condiciones de uso y atribución para BIMCV-COVID19
Los participantes pueden acceder y utilizar estos conjuntos de datos de imágenes desidentificadas y anotaciones con fines de investigación académica y educación, y otros fines comerciales o no comerciales, siempre que acepten los Términos y Condiciones descritos en este enlace.
Contacto
Si quiere saber más sobre el proyecto o ponerse en contacto con el equipo de investigación, escríbanos.